齐云山石刻位于休宁县城西15公里的齐云山上，该山因“一石插天，直入云端，与碧云齐”，故谓之“齐云”。景区有36奇峰，73怪岩，24幽涧，还有诸多的洞、瀑、泉、湖等自然景观，清乾隆皇帝下江南时，曾题联赞其为：“天下无双胜境，江南第一名山”。如此胜境吸引了众多的文人墨客和香火信徒，或赋诗题词，或树碑为记，被能工巧匠们镌刻于青石和悬崖峭壁之上，形成了蔚为壮观的“齐云山碑刻及摩崖石刻”，为齐云山人文景观最主要的内容。

齐云山是中国四大道教名山之一，始兴于唐。宋、明间香火极盛，游人如织。宋至民国间，游人香客在山上留下的摩崖石刻及碑刻据史料记载有1400余处。其中年代最早的为北宋大观和南宋绍熙年间的石刻，数量最多的为明、清两朝石刻和碑刻，其文字内容受“新安理学”和徽州文化的影响，融儒、道、佛三教为一体，书法有楷、行、草、隶、篆诸体俱全。大字丈余，小的尺碑千文，文体有诗词、传、赞、碑铭、赋记、颂、流文、表、会记及楹联、佳句等，流派纷呈，风格各异。有的雄劲豪放，有的柔婉秀丽，有的刚劲傲骨，有的飞龙走蛇；或以气胜，或以姿长，内容涉及寺观兴建、自然风光等，涵盖了地理、宗教、经济等方面。刻文多出自徽州名人如汪道昆、查士标、汪由敦等文人之手，其雕琢者又都是徽州石工，刻功精炼娴熟，不失原作神韵，珠联璧合，展示了徽州文学和徽派石雕工艺相溶合的强大魅力。在众多的碑刻中，规模最大的是矗立于玉虚宫左紫霄崖下的《紫霄宫玄帝碑铭》，高达760厘米，宽140厘米，为明代著名书画家唐寅所撰写，文笔流畅，书法工整苍秀。崖刻题字，尤以“天开神秀”、“齐云胜景”、“亘古齐观”、“寿”等气势宏伟，令人叹为观止。现当代著名作家郁达夫在他的《游白岳齐云之记》中感叹道：“我总想有一部伟大的《齐云金石志》好编。” 目前全山尚存537处（块），其中摩崖石刻305块，碑刻232块。

齐云山碑刻及摩崖石刻是一处书法艺术的宝库，是研究徽州石刻艺术难得的材料，是“新安理学”和“古徽州文化”中具有代表性的一处文化遗产。《齐云山风景名胜区总体规划》划定齐云山石刻保护区范围为120平方公里。分为绝对保护点、一级保护区、二级保护区。休宁县文物管理所负责齐云山石刻的保护，对石刻和碑刻全面进行化学药水清洗并采用化学药水封护，对重要的碑记进行了拓片并装裱整理。

1981年9月安徽省人民政府公布为“省级重点文物保护单位”。2006年被国务院公布为第六批全国重点文物保护单位。